2月19日，中央國家機關黨工委通報表揚（國工組綜〔2004〕3號文件），國家中醫藥管理局2003年黨內統計報表被評為優秀報表。
    2月26日，中央國家機關7部門（文明、綜治、綠化、計生、愛衛、交通、環境）通報表彰（國機精字[2004]1號文件），中國中醫研究院廣安門醫院、西苑醫院、眼科醫院為中央國家機關文明單位，國家中醫藥管理局關樹華同志為中央國家機關交通安全先進工作者，國家中醫藥管理局劉志旭同志為中央國家機關計劃生育先進工作者。
    2月27日，全國婦聯決定（婦字〔2004〕8號文件），授予中國中醫研究院廣安門醫院全國三八紅旗集體榮譽稱號。
    4月27日，中央國家機關工會聯合會決定，表彰中國中醫研究院西苑醫院血瘀證與活血化瘀研究項目組，并頒發中央國家機關“五一勞動獎狀”；表彰中國中醫研究院名譽院長、中國工程院院士王永炎同志、中國中醫研究院西苑醫院首席研究員、中國工程院院士李連達同志、中華中醫藥學會秘書長李俊德同志，并頒發中央國家機關“五一勞動獎章”。
    5月28日，中央國家機關工會聯合會（國機工字〔2004〕6號文件）通報，國家中醫藥管理局直屬機關工會獲2003年度中央國家機關工會財務工作先進集體二等獎。
    5月，國家中醫藥管理局辦公室秘書處吳厚新獲全國政府機關文印系統第一屆文稿校對比賽優秀獎。
    6月25日，衛生部直屬機關黨委（衛機黨發〔2004〕48號文件）決定，授予我局科技教育司黨支部等7個基層黨組織“衛生部直屬機關先進基層黨組織”稱號，馮興華等44名同志“衛生部直屬機關優秀共產黨員”稱號，楊毅民等11名同志“衛生部直屬機關優秀黨務工作者”稱號。
    7月16日，中央國家機關團工委宣布，國家中醫藥管理局機關薛侗枚獲中央國家機關青年英語演講比賽優勝獎。
    7月26日，財政部（財企〔2004〕121號文件）通報，國家中醫藥管理局辦公室規劃財務處為2003年度會計決算工作表揚單位。
    10月15日，中央國家機關團工委（國團工發〔2004〕7號文件）決定，命名中國中醫研究院廣安門醫院針灸科、中國中醫研究院西苑醫院藥劑科中草藥調劑組、中國中醫研究院望京醫院創傷一科護理組為2003年度中央國家機關青年文明號。
    11月 日，黃璐琦、王階、溫建民獲衛生部有突出貢獻中青年專家稱號。
    12月22日，中央國家機關黨工委（國黨工發〔2004〕74號文件）決定，授予中國中醫研究院西苑醫院主治醫師徐浩同志2002—2003年度中央國家機關杰出榮譽稱號，授予中國中醫研究院廣安門醫院主治醫師李光熙同志2002—2003年度中央國家機關優秀榮譽稱號，授予中國中醫研究院研究生部教師馬曉北同志2002—2003年度中央國家機關學習獎、望京醫院創傷二科副主任醫師桑志成同志2002—2003年度中央國家機關創新獎。